Trong giai đoạn 1988-1994, huyện thành lập thêm 3 xã: Ea Huar, Ea Rốk và Ea Wer.
Ngày 21 tháng 1 năm 1995, Chính phủ ban hành Nghị định 08/CP[5]. Theo đó, chuyển 3 xã: Cuôr Knia, Ea Bar, Ea Nuôl thuộc thành phố Buôn Ma Thuột về huyện Ea Súp quản lý.
Sau khi điều chỉnh địa giới hành chính, huyện Ea Súp có 10 xã: Cuôr Knia, Ea Bar, Ea Bung, Ea Huar, Ea Lê, Ea Nuôl, Ea Rốk, Ea Súp, Ea Wer, Krông Na.
Ng